Kwartalnik powstaje w ramach realizowanego przez Instytut Spraw Publicznych projektu „Budowanie przyjaznego środowiska społeczno-prawnego dla organizacji pozarządowych — KOMPAS”. Projekt ten ma ułatwić organizacjom pozarządowym wykorzystanie doświadczenia, zgromadzonego przez lata, w świadomym kierowaniu dalszym rozwojem trzeciego sektora. Podstawowe cele projektu to: zbudowanie trwałego mechanizmu analizowania sytuacji trzeciego sektora i proponowania kierunków jego rozwoju; zwiększenie wpływu organizacji pozarządowych na kształt uregulowań prawnych warunkujących ich funkcjonowanie. Oprócz wydawania kwartalnika „Trzeci Sektor” Instytut Spraw Publicznych prowadzi monitoring przepisów prawnych, opracowuje i publikuje ekspertyzy prawne, problemowe i strategiczne oraz organizuje seminaria eksperckie. Ponadto przygotowuje się do podjęcia litygacji strategicznej. Projekt finansowany przez Trust for Civil Society in Central and Eastern Europę oraz Fundację im. Stefana Batorego.